Ascalaph Designer

Ascalaph Designer er en generell program for molekylær dynamiske simuleringer. Under en enkelt grafisk miljø er representert som sin egen implementering av molekyldynamikk, så vel som metoder for klassiske og kvantemekanikk av populære programmer. Funksjoner inkluderer molekylære grafikk: flere vinduer, to kameraer per modell, CPK, Wire ramme, Stick, Ball og Stick, og CPK Wire rammestiler, molekylær modell bygge: krystall byggmester, kjetting byggmester, tegning av mus, molekylær geometri redigering, foreløpig optimalisering , quantum optimalisering, og sammenstøtene fjerne, molekylær geometri optimalisering med konjugat gradientmetoder, molekyldynamikk: multippel tid skritt integrering, fjerde orden integrasjon, superdatamaskin beregninger med hjelp av MDynaMix, fleksibel SPC vann modell, og implisitt vann modell, og kvantekjemi med bistand av CP2K og PC GAMESS / Firefly:. energi, molekylær geometri optimalisering, og potensialet avledet kostnader